Flávio Adauto foi anunciado como diretor de futebol do Corinthians no fim de outubro de 2016. O cargo estava vago desde a saída de Sérgio Janikian, em 2015. Ele deixou a posição no início de 2018 para se juntar ao candidato à presidência Paulo Garcia - ambos foram derrotados por Andrés Sanchez.

Adauto assumiu o papel de braço direito de Roberto de Andrade após a saída de Eduardo Ferreira, então diretor-adjunto. O diretor tinha como função principal planejar o elenco de futebol profissional.

O jornalista estava em segunda passagem pela diretoria do Corinthians. Ele foi vice-presidente de comunicação na gestão de Alberto Dualib até 2007. Ademais, é conselheiro vitalício do clube.